Ameeriklane sai eelujumises ajaks 47,77, mis andis alles 16. koha.

Üheks ebaõnnestumise põhjuseks võib olla asjaolu, et Phelps otsustas võistelda tavalises trikoos, sest alates uues aastast keelab Rahvusvaheline Ujumisliit moodsa tehnoloogia alusel valmistatud nn imetrikoode kasutamise.

Lisaks Phelpsile ei saanud üllatuslikult eelujumisest edasi ka prantslane Frederic Bousquet (47,53), austraallane  Eamon Sullivan (47,38) ja itaallane Filipo Magnini (47,74).

Eelujumiste kiireim oli rootslane Stefan Nystrand ajaga 45,93.