Varasema 16 meeskonna asemel mängivad Idaliiga põhihooajal sel korral 18 klubi kahes alagrupis.

Septembri alguses toimuvalt alagrupiturniirilt, kus osaleb kokku kuus meeskonda, pääsevad kaks paremat põhiturniirile.

BC Kalev/Cramo loositis A-gruppi:
1. BC Kalev/Cramo
2. BC Himki
3. Kaunase Zalgiris
4. Kaasani Unics
5. Riia VEF
6. Nižni Novgorod
7. Kasahstani Astana
8. Kiievi Budivelnik
9. Selgub A-gruppi alagrupiturniirist (Krasnojarski Jenisei, Espoo Honkaa, 
Wloclaweki Anwil)

B-grupp
1. Moskva CSKA
2. Lietuvas Rytas
3. Asseco Prokom
4. Mariupoli Azovmash
5. Peterburi Spartak
6. Minsk 2006
7. Nymburk (Tšehhi)
8. BC Lokomotiv-Kuban
9. Selgub B-gruppi alagrupiturniirist (Šiauliai, Krassnõje Krõlja, Dnepropetrovski Dnepr)