Merila töötab treenerina alates 1962. aastast, tal on treeneri V kategooria, teatab Rakvere Spordikeskus. Tema tuntumad õpilased on olnud maailmameister ja Eesti rekordiomanik Andrus Värnik, Moonika Aava ja Risto Mätas.

Alates 1978. aastast on Eesti naiste odaviskerekordit parandanud samuti peamiselt Merila õpilased: Eevi Virula, Raili Kadarik, Ruth Väät ja Moonika Aava. 2002. aastal käivitas Toomas Merila odaviskeprojekti “Peking 2008”, et luua parimatele ja andekatele noortele võimalus Pekingi olümpiaks valmistumisel.