Kubo liitus juba kümneaastasena Reali suure konkurendi Barcelonaga, kuid kuna Kataloonia suurklubi rikkus alaealiste mängijate ostmise reegleid, ei saanud jaapanlane neid esindada ja otsustas 2014. aastal klubist lahkuda.

Kodumaal liitus ründav poolkaitsja Tokyo FC-ga, kus tegi eelmisel hooajal ka suure läbilöögi, teenides juba kutse ka Jaapani täiskasvanute koondisse.

Kuigi andekast jaapanlasest oli väga huvitatud ka Barcelona, otsustas Kubo liituda Realiga, sõlmides pealinna meeskonnaga kuue aasta pikkuse lepingu.

Realis arvatakse Kubo esmalt reservmeeskonna koosseisu.