Milano Interi hingekirja kuuluv Nainggolan sõlmis Cagliariga laenulepingu hooaja lõpuni. Nainggolan viibis Cagliaris laenul ka kogu möödunud hooaja, kui tema kontole kogunes kuus väravat ja kuus resultatiivset söötu.

Belglane naasis suvel Interisse, kuid seal sai ta poole hooajaga kirja vaid ühe kohtumise. Lisaks mängis Nainggolan Cagliaris ka aastatel 2010-2014.

Nainggolani parimad aastad jäid AS Roma ridadesse, mille nimekirja ta kuulus aastatel 2014-2018. Kõigil neljal hooajal valiti ta Serie A sümboolsesse algkoosseisu. 2017. aastal pälvis ta AS Roma aasta mängija tiitli. 2018. aastal koondisekarjäärile joone alla tõmmanud poolkaitsja sai Belgia eest kirja 30 kohtumist ja kuus väravat.