Mõlemad liigad on jaotatud neljaks tsooniks – Põhja, Lõuna, Ida ja Lääne. III liigas tõusevad piirkondade võitjad II liigasse. Põhja (teisel juhul Lõuna) tsooni teise koha omanik läheb üleminekumängudes algselt vastamisi Ida (Lääne) piirkonna teise koha meeskonnaga, kellega mängitakse kodus-võõrsil printsiibil. Sealt võidukalt väljunud meeskond kohtub II liiga Põhi/Ida (Lõuna/Lääne) tsooni eelviimase meeskonnaga.

IV liigast tõuseb hooaja lõppedes kõrgemale tsoonide kaks paremat. Piirkonnas kolmanda koha saavutanud meeskond peab üleminekumänge III liiga vastava tsooni kümnenda võistkonnaga.

Eesti meistrivõistluste madalamate liigade koosseisud (2015):
III liiga
Põhja tsoon: Tallinna KSK FC Štrommi, JK Retro, JK Tallinna Kalev III, Rapla JK Atli, Nõmme Kalju FC III, Tallinna SK Dnipro, Tallinna FC Castovanni Eagles, SK Eestimaa Kasakad, Tallinna FC Olympic Olybet, Saku Sporting, Pirita JK Reliikvia, Tallinna FC Soccernet.

Lõuna tsoon: SK Tääksi, Põlva FC Lootos, Tartu JK Welco Elekter II, FC Otepää, Tartu FC Merkuur, EMÜ SK, Valga FC Warrior, FC Tartu, Tartu FC Santos II, Navi Vutiselts, Vastseliina FC Tannem , Tartu Ülikool Fauna.

Ida tsoon: JK Loo, JK Kaitseliit Kalev, Narva United FC, Kiviõli FC Irbis II, Koeru SK, FC Järva-Jaani, Tallinna FC Forza, Narva JK Trans II, Maardu United, Maardu FC Starbunker II, Rakvere JK Tarvas II, Ambla Vallameeskond.

Lääne tsoon: Läänemaa JK Haapsalu, Saaremaa JK aameraaS, FC Lelle, Pakri SK Alexela, Vändra JK Vaprus II, JK Kernu Kadakas , Lihula JK, Kärdla LM, Keila JK II, Pärnu Jalgpalliklubi, FCF Tallinna Ülikool II, Saaremaa Malev.

IV liiga
Põhja tsoon: Tallinna FC Hell Hunt, Kristiine JK , Tallinn JK Jalgpallihaigla, Tallinna FC Eston Villa, Tallinna FC Twister, Tallinna FC Reaal, Tallinna JK Piraaja II, Tallinna FC Majandusmagister.

Lõuna tsoon: FC Elva II, Suure-Jaani United, FC Helios Võru, Jõgeva FC Wolves, Tartu FC Bronx Wood , Tabivere RSK, Tartu JK Tammeka II , FC Tarvastu, Tartu JK Taara, SK Roosu.

Ida tsoon: Viimsi FC Igiliikur, Raasiku Valla FC, JK Väätsa Vald, Tallinna JK Augur, Tallinna FC Infonet III , Tabasalu FC Charma II, Harju JK, Tallinna FC Saksa Premium.

Lääne tsoon: Trummi SK, Pärnu JK Poseidon Nirvaana, FC Haiba, Pärnu JK Vaprus, Tallinna Depoo, Tallinna Jalgpalliselts, FC Toompea, RJK Märjamaa , Tallinna FC Zenit , Läänemaa JK Haapsalu II.