Rahvusvaheline Jalgratturite Liit (UCI) käivitas seepeale juurdluse, mille tulemusena määrati Boogerdile 2-aastane võistluskeeld (loe: jalgrattaspordis tegutsemise keeld) ja tagasiulatuvalt tühistati tema tulemused perioodil 2005-2007. Sellesse ajajärku jäävad näiteks Hollandi meistritiitel grupisõidus (2006), Tour de France´i 12. koht (2007), klassiku Amstel Gold Race´i teine koht (2005) jne.

Rattaspordis tegutsemise keeld kehtib hollandlasele kuni 21. detsembrini 2017. Ta jäi ilma ka töökohast. UCI otsuse järgselt oli Boogerd sunnitud tagasi astuma Roompot - Oranje Peloton profiklubi spordidirektori kohalt.

1998. aasta Tour de France´i viienda koha mees tunnistas 2013. aasta märtsis, et sõitis profina pea kogu karjääri dopinguainete najal. "Menüüsse" mahtusid vereülekanded, EPO ja kortikosteroidid.