Võttes arvesse Sei eeskujuliku käitumise ja tema poolt tehtud analüüsi juhtunule otsustas EUL juhatus lühendada võistluskeelu kestvust kahe kuu võrra ja lugeda Indrek Sei võistluskeeld lõppenuks alates 21. jaanuarist 2000 ning ennistada ta projekti Sydney 2000 alates 21. märtsist 2000.

Liikluspolitsei algatas septembris Sei suhtes kriminaalasja, kuna ta jäi kaks korda, 18. septembril ja 24. juunil, purjuspäi autot juhtides politseile vahele.

Kriminaalkoodeksi järgi oleks Seid olnud võimalik karistada kuni 36.900-kroonise rahatrahviga, juhiloa äravõtmisega ühest kuni kolme aastani või kuni kaheaastase vabadusekaotusega.

Eesti ujumisliit määras algselt Seile purjuspäi autojuhtimise eest poole aasta pikkuse võistluskeelu ja arvas ta välja olümpiaprojektist Sydney 2000. Lisaks võttis tippujuja üks sponsoreid firma ASC Seilt ära talle kasutada antud BMW 325.

Teisipäeval, 14. detsemberil mõistis Tallinna linnakohus Seile rahatrahvi, kuid ei pööra karistust täitmisele.

Kohus mõistis Seile 8200 krooni trahvi ja jättis Sei aastaks autojuhtimisõiguseta, kuid andis ujuja Eesti Sportlaste Ühenduse käendusele ega pööra seetõttu otsust täitmisele. Seega pääses Sei rahatrahvi maksmisest ning talle jääb alles ka autojuhiluba.

Sei tunnistas kohtu ees oma süüd ja kinnitas, et ei juhi enam kunagi autot purjuspäi.