Loosimistseremooniat viisid läbi: SEB Vilnius Banka president Audrius Žiugžda, SEB BBL president Ojars Kehris, Leedu Korvpalli Föderatsiooni president Vladas Garastas, SEB BBL juhatuse liige Peep Aaviksoo.
2006/2007 hooaja SEB BBL tiitlile alustab võitlust 14 meeskonda.
Esimeses staadiumis (september — detsember 2006) jaotatakse meeskonnad kahte võrdsesse alagruppi. Kõik kohtuvad vastastega kodus/võõrsil.
Grupp A: BC Zalgiris Kaunas, Šiauliai, Valmiera Lacplesa alus, Riia Barons/LU, Vilniuse Sakalai, BC Kalev/Cramo, Klaipeda Neptunas.
Grupp B: Lietuvos rytas, BK Ventspils, Kedainiai Nevezis , Panevezys, TÜ/Rock, Kaunas Atletas, Riia ASK.
Teises staadiumis (jaanuar — märts, 2007) moodustavad mõlema alagrupi 3 parimat meeskonda 1. divisjoni ja ülejäänud 8 meeskonda 2. divisjoni. Seda kõike eelkõige selleks, et pakkuda fännidele ja toetajatele veelgi võrdsemaid vastasseise.
SEB BBL play-offid algavad märtsis 2007. Kaheksandikfinaalides kohtuvad 1. divisjoni 5. meeskond ja 2. divisjoni 2. meeskond ning 1. divisjoni 6. võistkond kohtub 2. divisjoni 1. meeskonnaga Mängitakse süsteemis kodus/võõrsil, võitja selgub punktide vahega.
Veerandfinaalides kohtuvad omavahel: 1. divisjoni 3. võistkond 1. ringi play-off paar võitjaga ning 1. divisjoni 4. võistkond kohtub 1. ringi teise play-off võitjaga. Mängitakse samas süsteemis nagu kaheksandikfinaalis. Veerandfinaalide võitjad omakorda saavad õiguse võidelda koos 1. divisjoni 2. paremaga SEB BBL 2006/2007 hooaja meistritiitlile Final 4-s.
Uus turniirisüsteem rajaneb puhtalt võrdsuse printsiibil, nagu SEB Vilnius Banka president Hr. A.Žiugžda mainis: “Kui SEB pangad pakuvad kõrgeimat kvaliteeti majanduse vallas, siis SEB BBL peab pakkuma kõrgeimat kvaliteeti korvpallis.”
